Antes de emprender una obra de estas características, y teniendo en cuenta los graves deterioros sufridos, fue fundamental un completo estudio de las formas de trabajo empleadas en la construcción original. En este caso concreto fué fundamental investigar a cerca de la cubierta, tanto en lo referente a su resistencia como a su impermeabilidad.
También mereció atención especial el estudio de los contrafuertes que son los que transmiten a la cimentación los esfuerzos que les comunica la bóveda.
El proyecto constó de cuatro etapas.
- Inicio de obra y trabajos previos a las intervenciones estructurales de las bóvedas.
- Montaje de cubierta provisional y excavación en extensión del extradós de las bóvedas de la nave principal.
- Restaurar las bóvedas de la nave principal y colocación de la nueva cubierta.
- Atado de las capillas adosadas al primitivo edificio, zunchado y tratamiento de cornisas, realización de una nueva cubierta y sistema de recogida de aguas pluviales.